善良的女秘书本剧讲述了主人公菅原优我（大桥和也 饰）为调查兄长之死，潜入可疑的医疗IT公司“蔺牟田医疗数据”，在明为销售、暗为间谍的双重身份中展开行动。他接近公司社长千金蔺牟田花（涩谷凪咲 饰）以获取情报，却意外对其动心，在复仇与爱情之间陷入挣扎。